Trong thời gian 100 năm, Sư Tổ đã chứng kiến biết bao thăng trầm biến cố lịch sử: Nội chiến Nam – Bắc triều giữa Lê – Mạc. Rồi chúa Trịnh ra đời giương cao ngọn cờ "Phù Lê diệt Mạc” nhằm biến vua lê thành bù nhìn. Tấn tuồng Vua Lê - Chúa Trịnh đã kéo dài